User-specific application configuration is traditionally stored in so called dotfiles (files whose filename starts with a dot). – dotfiles (ArchWiki)
Ez egy elegáns megoldás a home dir kezelésére: The best way to store your dotfiles: A bare Git repository
Git repóval használhatunk ansible-pullt is.
Léteznek külön e célra fejlesztett eszközök is, mint pl. a chezmoi.